空军特色医学中心成立于2018年9月，由原空军总医院、空军航空医学研究所、载人离心机医学训练基地和空军疾病预防控制中心4个单位调整组建，直属空军军医大学（第四军医大学）。

中心总占地面积416.4亩，总建筑面积71.2万平方米，共编设50余个临床、医技科室，展开床位1500余张，年门诊量280万余人次，收治量约5.9万余人次，手术2.7万余台次，日门急诊量近1.1万人次。现有中国工程院院士1名，院士工作站2个、技术3级以上专家10名，中央和中央军委保健会诊专家11名，任军地学术团体副主委以上职务34名，特聘专家11名。拥有15 G高性能大型载人离心机、40 km低压复合环境试验舱群、空间定向障碍模拟器、达芬奇手术机器人、PET-MRI、高低场核磁等高端医疗科研设备，医疗科研设备总值近20亿元。

中心共有国家临床重点专科军队建设项目3个（皮肤科、放射治疗科、空勤科）、国家中医药管理局重点学科3个（皮肤科、中西医结合正骨科、中医科）、全军临床重点专科5个（航空临床医学科、皮肤科、中西医结合正骨科、口腔科、消化内科）、全军医学专科（专病）中心8个（全军临床航空医学中心、全军中西医结合正骨治疗中心、全军半匹配骨髓移植中心、全军肿瘤放疗中心、全军小肠疾病内镜诊治中心、全军泌尿微创诊疗中心、全军优生优育技术指导中心、全军心理技术指导中心）、空军临床重点专科7个（普通外科、骨科、胸外科、临床检验科、放射治疗科、康复医学科和重症医学科）。拥有4个全军重点实验室和26个专业实验室，是国家药物和医疗器械临床试验机构，空军飞行人员医学选拔诊治终极鉴定机构，医保A类定点医院，北京市母婴友好医院。先后获得国家、军队科技奖励449项、国家科技进步奖22项、军队科技进步二等以上奖励125项。