先天性房间隔缺损的治疗，要具体情况具体分析，主要根据患者的年龄和病情的严重程度而定。对于年龄比较小、病变比较轻的房间隔缺损，如房间隔缺损只有2-3mm或儿童在5mm以下，也没有明显的右心系统扩大，可以定期观察，甚至有可能终身无需处理。
对于缺损比较大、年龄也比较大，且右心系统明显有扩大、出现肺动脉高压的情况，则提示需要处理。处理的方式有传统的开胸手术，对于合适的患者，现在也可以采用微创封堵。即通过封堵器将房间隔缺损的两端闭合，让血流不再混合，达到治疗的目的。
所以先天性房间隔缺损的治疗是个体化治疗，即针对每一个患者的不同情况，采取不同的策略。
