通常患肛周脓肿，多数需要手术切开引流。患有肛周脓肿时肛门内如果有脓液，可能会疼痛剧烈，此时通过手术将脓液放出，病人可能会明显缓解疼痛，将脓液放出有利于伤口逐渐愈合，防止细菌进一步感染和扩大。
部分肛周脓肿患者不希望手术治疗，想要通过拔脓膏或者药膏使脓肿自行破裂，自行流出来，但是需要时间较长，病人忍受痛苦时间也较长。如果使用拔脓膏，患者并不知何时能发生脓肿破裂、脓液流出，而且破裂切口脓肿引流也不彻底，对脓肿愈合、治愈无法起到很好的作用。所以肛周脓肿建议最好要手术切开引流，既恢复较快，又能使病人减少痛苦时间。
