肾脏里的小结石，常常没有症状。当结石掉到肾盂输尿管交界处时，会引起输尿管梗阻，会出现肾盂积水，会出现腰酸、腰痛症状。当输尿管结石掉入输尿管引起上段输尿管痉挛时，会出现剧烈的肾绞痛症状。病人会出现腰腹部阵发性剧烈绞痛，疼痛向会阴部放散，伴有恶心、呕吐症状，部分病人还有肉眼血尿症状。
如输尿管较大时引起输尿管梗阻，引起肾积水，还会出现腰部胀痛，还会出现发热症状，病人还会出现感染性休克症状。泌尿系结石还有病人会出现尿频、尿急、尿痛症状，当结石掉入输尿管末端时，会出现里急后重表现。