甲型H1N1流感的症状包括起病急，表现为高热，体温一般在38.5℃以上，可以达到39-40℃，伴有全身的感染中毒症状，表现为食欲减退、头疼、畏寒，全身肌肉、关节疼痛，还有恶心甚至可以出现呕吐。对于甲型流感患者，除了全身的症状表现以外，可以出现局部的呼吸道症状，明显的咽痛或者干咳。
有些患者严重的可以出现气促、活动后呼吸困难，少部分患者可以伴有消化道的症状，伴有恶心、呕吐、腹痛或者腹泻。严重的患者可以出现流感肺炎，一般见于有严重的基础疾病、孕妇、肥胖以及长期应用免疫抑制剂免疫功能低下的患者，可以出现流感肺炎的表现，严重的可以出现缺氧、口唇发绀、呼吸气促，这种情况需要及时到医院就诊。