肠息肉微创手术即在肠镜下进行手术，肠息肉的癌变几率相对比较高。比较大的肠息肉还可能会引起肠套叠，甚至肠梗阻，所以在临床上医生都建议进行手术治疗。手术分为肠症下的微创手术、经肛门切除和开腹手术切除，主要根据息肉的大小、部位选择不同的手术方式，肠息肉微创手术就是肠镜下的手术。
结肠镜下切除手术有分为凝除术、钳除术、圈套术、内镜黏膜切除术和内镜黏膜下剥离术，肠息肉微创手术前会指导患者进行肠道清洁工作，需要喝泻药，如番泻叶或进行灌肠，直到患者排出清水后再在肠镜下进行微创手术。
医生会将肠镜带有镜头的一根细管插入到肠道，通过旁边的电脑显示屏可以看到肠道内的情况进行手术，微创手术的创伤小、愈合快，不会有明显的不适感。