口腔溃疡的治疗可以在口腔溃疡面上喷涂西瓜霜喷剂、口腔炎喷雾、开喉剑喷雾或者采用康复新液漱口，这些均能促进口腔黏膜上溃疡的愈合。如果溃疡面疼痛得非常剧烈，可以在溃疡面上涂抹利多卡因凝胶来止疼。
也可以用普鲁卡因溶液漱口来止疼。患有口腔溃疡的人群一定要多吃新鲜的蔬菜和水果来补充充足的维生素C，这也有利于口腔溃疡的愈合，饮食上要避免辛辣、刺激性和过烫的食物，以免对溃疡面造成刺激。
如果存在着熬夜和黑白颠倒现象，这类人群要尽量保证作息有规律，如果是身体免疫功能极度低下所造成的口内溃疡长期不愈合，可以适量的服用增强免疫功能的药物，比如胸腺肽和匹多莫德进行治疗。