阿莫西林胶囊和布洛芬属于完全不同的两种药物，作用机制和临床用途也不同。阿莫西林胶囊是一种青霉素类的药物，是一种广谱的抗生素类药物，适用于敏感菌引起的感染。布洛芬属于解热镇痛的药物，用于缓解轻至中度疼痛，如头痛、关节痛、偏头痛、牙痛、肌肉痛、神经痛、痛经，也可以用于普通感冒或流行性感冒引起的发热。
如果病情需要，两个药可以一起使用，二者之间不存在配伍禁忌，可以起到相互协同作用。需要注意的是两个药对胃肠道都有一定的刺激作用，同时服用可能会增加胃肠道不良反应，饭后服用或者分开服用会减少不良反应的发生。