病毒性角膜炎基本的治疗原则是抑制病毒的复制，促进角膜上皮修复，控制角膜基质层的水肿和炎症细胞的浸润，比如最常见的单纯疱疹性角膜炎。
如果出现点状角膜上皮脱落和树枝状角膜炎时，需要用抗病毒的眼药水，频繁的点眼，同时也需要用促进角膜上皮修复的药物。
如果出现盘状角膜炎的状态时，可以在用抗病毒药物的基础上，在医生的指导下适当的应用类固醇激素眼药水，可以控制角膜基质层的水肿，减轻炎症细胞的侵润，减少疾病恢复后瘢痕的形成。
注意在树枝状角膜炎感染的状态下，尽量不要用类固醇激素眼药水，因为这时类固醇激素可能会激活病毒，引起病毒向深层组织的侵犯。