睡觉时间长了腰疼可能有以下几种原因：第一、腰肌劳损和腰背肌筋膜炎，这两种疾病常是由于长期弯腰持物、弯腰工作，或者是久坐、着凉等原因而引起，在睡醒觉之后出现腰疼，而在活动一会之后腰疼就能减轻。第二、类风湿性脊柱炎，当类风湿累及脊柱时，就可以出现睡觉之后的腰疼，这时要进行相关血的化验以及腰椎的X线片、CT的检查进行诊断。第三、强直性脊柱炎，强直性脊柱炎的患者可以出现睡觉之后腰疼，常伴有腰部僵硬的症状，这时要进行相关血的化验以及腰椎的X线片、核磁的检查，进行诊断和治疗。