六味地黄丸具有滋补肝肾的作用，主要用于治疗肾虚腰疼，因此不会引起腰疼的现象。如果吃了六味地黄丸发生腰疼，可能是腰部本身有一些基础疾病所引起，比如可能会有腰肌劳损、腰椎间盘突出等疾病，这类疾病会出现腰疼，六味地黄丸对这类疾病没有治疗作用。
另外，还有可能是腰椎的肿瘤、结核、细菌感染、化脓性脊柱炎等疾病引起，一些妇科炎症、子宫附件炎、盆腔炎，还有男性的前列腺炎引起的腰疼，还有像肾结石、肾炎等疾病都可能会导致腰疼。因此，如果吃了六味地黄丸之后发生腰疼，大多不考虑是六味地黄丸引起的症状，建议到医院及时就诊进行检查，查明原因后进行对症治疗，当然六味地黄丸还是要停药，不建议再继续服用。