阴茎上有疱疹，应该采取综合治疗的方法，如下：
第一、口服抗病毒药物，比如泛昔洛韦、伐昔洛韦或者更昔洛韦药片，治疗的剂量和疗程要依据治疗的效果，以及按照医生的医嘱来进行。
第二、局部用药，常用的有抗生素软膏、抗病毒软膏、抗真菌软膏，抗病毒软膏可以使用喷昔洛韦或者更昔洛韦乳膏。如果合并细菌或者真菌感染，会使用到抗生素软膏，比如百多邦、达维邦，还有抗真菌软膏，比如克霉唑、咪康唑软膏。
第三、对症治疗的药物，有些人会出现比较明显的疼痛，可以口服布洛芬进行缓解疼痛。如果出现浑身发热，也可以采用相应的退热治疗。
大多数人的疱疹大约3-4周可以治愈，但是很多人在感染的前一年内发作会比较频繁，复发一般症状会比初发要轻一些，治疗的疗程相应也可以缩短。