要想确定附睾炎是无菌性的，通常要进行精液的细菌培养。如果多次培养细菌结果都是阴性，可以确定附睾炎是无菌性。附睾炎分为急性附睾炎和慢性附睾炎，以急性附睾炎为多见，大多数是由泌尿系感染和急性前列腺炎、精囊炎、性传播疾病扩散所致，也就是多数是有致病菌的，常为大肠埃希氏菌、淋球菌、衣原体、支原体等等。
慢性附睾炎多数是由急性附睾炎治疗不彻底而形成，部分病人没有急性炎症的过程，但可以伴有慢性前列腺炎。如果应用了一定疗程的抗生素，细菌有时候是可以被彻底杀灭的，但是组织学形成的瘢痕并没有完全消散，所以仍然存在硬结。这时候可能培养不出细菌，但是仍然存在疼痛等症状。有种特殊情况就是附睾结核，结核做普通细菌培养也是培养不出细菌的，但是要做结核杆菌培养，有时候可以出现阳性的结果。