益生菌选用下面的两个时间段吃效果最好：
1、刚起床时：因为孩子在刚起床以后没有吃食物，也没有剧烈活动，此时孩子胃液中的胃酸浓度相对来说比较低，从而可以最大限度的减少益生菌对胃酸的破坏程度，有利于益生菌发挥更大的疗效。因为孩子在活动以后，尤其在进食以后，胃酸会分泌得比较多，此时再给孩子进食益生菌，往往会造成益生菌药效的下降。
2、夜间睡觉前：孩子在夜间入睡之前，胃酸相对来说分泌也不活跃，此时给孩子服用益生菌，也可以最大程度的发挥益生菌的疗效。
益生菌大多可以调整孩子由于肠道菌群紊乱，而造成的恶心、呕吐、厌食、腹痛、大便偏稀或者大便干结等一系列的症状。另外益生菌可以降低孩子的过敏体质状态，从而缓解孩子的湿疹、支气管哮喘等过敏性疾病的症状。综上可知孩子在服用益生菌的时候，早起刚起床空腹时服用，或者在夜间睡眠之前进行服用最为恰当。