慢性细菌性前列腺炎的治疗，最常用的药物是抗生素、α受体阻滞剂、植物制剂和非甾体抗炎镇痛药，其他药物对于缓解症状也有不同的疗效。以上几种药物具体作用如下：
1、抗生素，在慢性细菌性前列腺炎的临床实践中，最常用的一些药物就是抗生素，通常选择的是喹诺酮类抗生素、大环内酯类抗生素。应用的周期为4-6周，其中两周对患者进行阶段性的疗效评价，疗效不满意的时候，需要改用其他敏感抗生素。
2、α受体阻滞剂，能够松弛前列腺和膀胱等部位的平滑肌，而改善下尿路症状和疼痛，因此也是慢性细菌性前列腺炎治疗的主要药物。
3、植物制剂，主要是通过非特异性抗炎、抗水肿，促进膀胱逼尿肌收缩与尿道平滑肌松弛，来达到改善症状的目的。
4、非甾体类抗炎镇痛药物，主要是一种经验性用药，其目的是缓解疼痛和不适。
对于有膀胱过度活动症的患者，可以用M受体阻滞剂。有的时候也可以对于有精神问题的患者，使用抗抑郁药和抗焦虑药物。同时，中医药也有一定的疗效可以应用，其他的辅助治疗还包括前列腺按摩、生物反馈等治疗。