肾盂肾炎又叫做上尿路感染，造成肾盂肾炎最常见的病原体主要是细菌，占到95%以上，其中以革兰阴性杆菌为主，大肠埃希菌占到70%以上。除了细菌以外，少部分的尿路感染由真菌、衣原体、支原体或者病毒造成。在单纯性上尿路感染中除大肠埃希菌以外，其他细菌也可以见到，包括肠球菌属、葡萄球菌属、克雷伯氏菌属、假单胞菌属等等。这些细菌在近年上尿路感染中开始明显增多，给治疗带来一定的难度，原则上需要根据尿培养的结果选择敏感抗生素。