滴虫病的症状在男性主要表现为急性的非淋球菌性尿道炎症状，在一部分人身上可能表现为前列腺炎、附睾炎、包皮龟头炎以及无症状带菌状态。非淋球菌性尿道炎是最常见的症状，主要是尿频、尿急、尿痛，尿道分泌较多脓性分泌物，颜色比较稀薄，有时会呈现白色，同时会有尿道瘙痒感。通常治疗上使用甲硝唑、替硝唑或者奥硝唑进行治疗，常用的抗生素比如左氧氟沙星、阿奇霉素、头孢地尼等，对于滴虫有一定的治疗作用。
如果急性尿道炎没有控制好，一部分人可以逆行感染，导致尿频、尿急、排尿困难、小腹及会阴胀痛等前列腺炎的症状，以及出现附睾肿大、疼痛、红，并出现硬结的附睾炎症状。一部分人会出现包皮龟头的瘙痒、分泌物增多，以及灼痛感。对于一部分患者，感染滴虫后可处于携带状态，而不出现症状。