核磁共振检查是目前所有影像检查中级别相对较高级的检查方式，相对于X光、CT检查，其伤害性较小，而其他两种检查方式则具有一定辐射。
另外，核磁共振检查对人体主要是发热的影响，由于核磁共振检查过程、时间较长，因此可能造成人体发热。同时核磁共振应用的范围和X光、CT检查有一定区别，目前主要对于心脑血管疾病、肌肉及骨骼疾病具有相对较高的诊断价值。