Ⅰ型呼衰与Ⅱ型呼衰的区别包括发病的机理不同，Ⅰ型呼衰主要是因为肺的换气功能障碍导致，常是因为肺的弥散功能障碍以及肺动静脉分流而形成，此时患者多见于重症肺炎、间质性肺病、肺栓塞，以及严重的气胸、大量胸腔积液等患者。
Ⅱ型呼衰多是因为肺的通气功能障碍而引起患者出现不同程度的二氧化碳潴留，可以伴有低氧血症的临床表现，多见于慢性气流阻塞性疾病，例如慢阻肺、严重的支气管哮喘、支气管扩张等。
另外，血气分析也有不同，Ⅰ型呼衰主要是氧分压小于60mmHg，不伴有二氧化碳分压的升高，Ⅱ型呼衰主要是二氧化碳分压大于50mmHg或低氧血症的表现。治疗也不同，Ⅰ型呼衰主要是适当的高浓度吸氧，而Ⅱ型呼衰多是低流量、低浓度吸氧，必要时两者均可以予以呼吸机的辅助呼吸治疗。