扁平疣是由于人体免疫低下感染疣病毒引起，治疗上首先可以选择调节免疫治疗，可以选择调节免疫的药物，比如胸腺肽胶囊或者匹多莫德口服液、香菇菌素片、转移因子胶囊、脾氨肽冻干粉剂。可以外用抗病毒的药膏，比如重组人干扰素软膏，也叫安达芬软膏；也可以用维甲酸类药膏，比如睡前涂用一次维A酸乳膏，需要注意的是，本药膏一定要夜晚睡前外涂，不要白天涂抹，因为本药膏涂后要避免日晒。此外，可以应用果酸外涂治疗扁平疣，还选择中医中药疗法。