二妙丸和四秒丸的区别有以下几种：
第一、成分不同，四妙丸由黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝组成，二秒丸由黄柏、苍术组成，四妙丸比二妙丸多出了薏苡仁和牛膝两种成分。
第二、药物制法不同，二妙丸是由苍术和黄柏按照1:1的比例粉碎以后，炒制而成的，四妙丸是把四种药物成分研碎以后，自然晾干而制成的。
第三、药物的功效不同，二妙丸和四妙丸都是以除湿、清热为主，用于湿热病，而四妙丸在二妙丸的基础又添加了治疗湿热、瘘痹的症状，二妙丸具有明显的免疫抑制作用，而四妙丸比二妙丸多添加了牛膝、薏苡仁，不仅有明显的免疫调节作用，还能增强抵抗力。