男性不育的分类方法非常多，按照不育的原因进行分类，可以分为以下几种情况：
第一、按照影响男性生育环节的病因进行分类，分为内分泌因素、睾丸因素、附属性腺因素、射精过程障碍因素、输精道梗阻因素、性生活因素、阻止精子穿过宫颈黏液的因素，以及干扰精子的获能与受精的因素，这些引起的不育。
第二、按照造成男性不育的疾病因素进行分类，可以分为先天性生殖器官发育异常因素、遗传性疾病导致的不育、内分泌性疾病导致的不育症、生殖器感染引起的不育症、精索静脉曲张引起的不育症、性功能障碍导致的不育，还有理化因素所导致的不育。精神心理因素导致的不育，也分在这个类型下。
第三、按照精液的特性进行分类，分为少精子症、精子活力低下，以及死精子症、无精子症、精液量异常、精液不液化、精液畸形百分率过高、精液酸碱度异常等引起的不育。