房间隔缺损大多数不能自愈，通过手术或介入治疗，把缺损的房间隔修补或者封堵，可以达到治愈的目的，目前技术成熟，疗效尚好。房间隔缺损属于先天性心脏病，如果房间隔缺损较轻，没有血流动力学紊乱，随着婴幼儿的成长有报道自愈的病例。
对于中、重度缺损的患者，不能自愈，建议及时就医。合理、有效的治疗对于改善房间隔缺损患者的预后都非常重要。