肾结石掉到输尿管当中会引起剧烈的肾绞痛，在治疗上首选肾绞痛的止痛治疗，可以先考虑用非甾体类消炎镇痛药，比如双氯芬酸钠、吲哚美辛、布洛芬等。如果强度不够镇痛，可以配合使用解痉药，比如M型受体阻滞剂阿托品、654-2，或者黄体酮、硝苯地平、坦索罗辛、多沙唑嗪等，这类解痉药物通常能够松弛输尿管，缓解疼痛。
如果仍然不能止痛，可以考虑更强的镇痛药，使用阿片类镇痛药，比如吗啡、曲马多、布桂嗪等。如果镇痛药仍然不能缓解疼痛，通常考虑外科治疗，包括体外冲击波碎石治疗、输尿管内放置支架管、输尿管镜碎石取石术以及经皮肾造瘘引流术等等。特别是对于解剖上或者功能上的孤立肾来讲，除了止痛以外更要尽快解除梗阻。