目前尚未发现对新型冠状病毒有效的抗病毒药物，在抗病毒药物的应急性临床试验过程中，相继开展了多项临床试验，虽然仍未发现经严格的随机、双盲、安慰剂对照研究证明有效的抗病毒药物，但某些药物存在一定的潜在治疗作用，可以推荐有重症倾向的患者早期试用，α干扰素、磷酸氯喹可以试用。尽管目前对新型冠状病毒没有特效的抗病毒药物，但绝大多数患者可以治愈。
新型冠状病毒感染治疗包括以下几个方面，根据病情的严重程度确定治疗场所，疑似病例和确诊病例应该在具备隔离条件和防护条件的定点医院进行隔离治疗。危重型的病例应该尽早收入ICU治疗，患者应该卧床休息，加强支持治疗，保证充足的热量，及时给予有效的氧疗措施，如鼻导管吸氧、面罩吸氧、无创通气以及气管插管，对患者进行血常规、生化指标、动脉血气、肺部影像学的监测，抗病毒治疗可以试用干扰素、磷酸氯喹等药物。