牙根感染不会导致三叉神经痛，因为其病因不同。牙根的感染，主要是由细菌而引起的，最常见的是由龋病、牙髓病引起，然后细菌达到了根尖区来引起感染，也可以由深的牙周袋达到根尖区，引起逆行性的根尖周围炎。
而三叉神经痛主要是三叉神经出现脱髓鞘改变，或者是三叉神经走行的过程当中，受到邻近的血管或者是骨壁的压迫，而引起剧烈的疼痛。所以牙根的细菌感染不会导致三叉神经的脱髓鞘，或者是压迫引起的剧烈疼痛，两者完全是两个疾病。
但是在某一个人的同一个区域，既可以有牙根的根尖炎症，也可以有局部的三叉神经痛，两个疾病可以同时发生在一个部位。