精子畸形率为98%，如果已经成功怀孕，这种情况基本没有影响。患者精子畸形率为98%，这种情况想要受孕基本是很困难，因为只有正常的精子才可以穿透卵子，从而使女性受孕。患者只有2%的正常精子，所以想要成功受孕是比较困难的，但如果在这种情况下已经使女方怀孕，说明患者仍然存在正常精子，只要可以使女方怀孕，大多数情况下精子都是比较健康，这种情况不会产生什么影响。建议患者如果精子畸形率比较高，但是已经使女方怀孕，在怀孕期间应当进行严格的孕期检查，保证胎儿的健康成长，一旦发现问题，及时采取相关措施进行治疗。