机体感染了乙型肝炎病毒有部分人可以自愈，多数人在感染了乙型肝炎病毒后，可以通过自身免疫反应将乙型肝炎病毒清除，在清除乙型肝炎病毒的过程当中，有部分人可能没有任何临床症状，或者仅有轻微的临床症状，也未引起留意。有部分人在清除乙型肝炎病毒的同时，可能出现了典型的临床症状，如乏力、厌食、厌油腻、黄疸等，还有肝功能异常。
绝大多数人当临床症状消退之后，乙型肝炎病毒也可以清除，仅有少部分的人在乙型肝炎病毒感染六个月之后，仍未将乙型肝炎病毒清除，主要是由于机体的免疫功能低下而引起。因此，这部分人可以转变为慢性的乙型肝炎病毒携带者，还有极少数人在清除乙型肝炎病毒同时，由于机体的免疫反应亢进，引起了肝细胞大量坏死，出现了肝衰竭，因为肝衰竭会使死亡率增加，肝衰竭就是在短期之内出现了大量的肝细胞坏死，可以出现高度黄染、肝性脑病、肝脏缩小等严重的病情变化。