临床上的甲状腺炎，通常包括细菌感染引起的化脓性甲状腺炎，以及继发于上呼吸道感染以后，出现的亚急性甲状腺炎和自身免疫性的疾病，引起的慢性淋巴细胞性甲状腺炎。对于细菌感染引起的急性化脓性甲状腺炎，通常治疗上采用抗生素治疗，由于其感染的常见细菌是金黄色葡萄球菌，所以首选青霉素类的或者头孢类的抗生素治疗，如果形成脓肿，通常需要及时的切开引流。亚急性甲状腺炎由于继发于上呼吸道病毒感染以后导致的甲状腺滤泡破坏。治疗上主要采用激素类的药物，糖皮质激素，比如泼尼松缓解颈部疼痛症状。慢性淋巴细胞性甲状腺炎由于会出现轻度的甲减症状，所以治疗上主要是采用甲状腺素片口服，以补充甲状腺素合成与分泌不足而引起的甲减症状。