13价肺炎球菌多糖结合疫苗注射后的不良反应，包括十分常见的、常见的、偶见的和罕见的分为四大类。
十分常见不良反应是指的发生率≥10%的。主要有食欲下降、易激惹、嗜睡、睡眠增加、入睡困难、睡眠减少。还有就是发热，注射部位红斑、硬节、肿胀、疼痛、触痛。
常见的不良反应发生率在≥1%，而小于10%的，可有腹泻、呕吐、皮疹。超过39℃的发热，注射部位红斑或硬结，注射部位疼痛和触痛并影响运动。
偶见的不良反应发生率≥0.1%，而小于1%的，哭闹、惊厥包括热性惊厥，荨麻诊或前发疹样皮疹，注射部位硬结肿胀红斑>7cm。
罕见的不良反应就是发生率≥0.01%，但是又小于0.1%，主要有过敏反应，包括面部水肿，呼吸困难和支气管痉挛。另外还可以出现低张力，低反应事件。