生殖科主要检查男性生殖功能，首先检查男性外生殖器发育是否正常，通过男性外生殖器检查可以发现阴茎发育是否正常、是否有尿道下裂、是否有尿道上裂、是否有包茎和包皮过长，生殖科检查还包括双侧睾丸大小、形态、位置是否正常，通过生殖科检查可以初步判断睾丸生殖功能是否正常。
生殖科检查还应检查精液常规，通过精液常规检查常常可以发现精子数量是否正常、精液量是否正常、精子液化时间是否正常、精子畸形率是否正常、精子密度是否正常，通过精液常规检查，可以初步判断病人生殖功能是否正常。