男性发生尿道炎后需要口服药物治疗，尿道炎最常见的致病菌是革兰氏阴性双球菌，或解脲支原体引起的非淋菌性尿道炎，还见于表皮葡萄球菌或溶血性链球菌引起的尿道炎。男性尿道炎应当选用合理的抗生素治疗，如选用盐酸米诺环素治疗。
盐酸米诺环素治疗可以杀灭淋球菌，同时对衣原体、支原体感染也有一定的疗效。男性尿道炎还可以口服磷霉素氨丁三醇散治疗，磷霉素氨丁三醇散对尿路各种致病菌均有一定的疗效。男性尿道炎还可以口服中成药物治疗，如选用热淋清颗粒，热淋清颗粒对尿路刺激症状有明显的疗效。