病理科是一个诊断科室，其主要任务是通过外科手术获取标本，或者通过细针穿刺获得的组织细胞，还有尸检、腔镜下钳取等方式获得组织或细胞，在其显微镜下通过其形态学改变，而给予诊断的一门形态学科，主要是判断疾病的性质，为临床提供有力的治疗依据，判断其预后。
病理科一般在大型综合医院中处于必不可少的地位，随着医疗技术的发展，病理科除了通过HE染色之外，还采用免疫组织化学染色、基因检测、原位杂交等手段，对疾病进行评估和预后判断，也可以指导某些肿瘤是否选择通过靶向药物治疗。