碳13是碳14的改良版，碳13的准确性更高，碳13的准确性达到99%，是国际公认的金标准，而碳14的准确率在70%左右，并且碳13无放射性，碳14有长期的放射性。
碳13呼气试验是最新的快速并且无辐射的检测技术，不需要胃镜，只要轻松呼气，测定呼气成分即可，患者配合度更高，治疗后复检无心理负担，也为临床医生提供了更好的参考依据。另外，碳13更适合于老年人、儿童、孕妇等使用，因为其没有放射性，临床应用范围更加广泛。
碳14也是呼气试验，但它是放射性同位素，会产生β射线，这是一种可以造成离子化的射线，是人类日常生活中接触到的具有致癌性的因子。所以虽然两者的准确性差别不是特别大，但是目前临床的检查更倾向于进行碳13检查。