治疗细菌性前列腺炎并没有特效药，在选择药物之前，最好能够根据前列腺液培养结果，明确具体细菌的种类以及药物敏感性，然后再选择抗生素会比较稳妥。目前敏感度比较高的抗生素主要有左氧氟沙星片、呋喃妥因片、磺胺嘧啶片、头孢呋辛酯片等，需要持续治疗一段时间后才能够彻底清除前列腺当中的细菌。
在治疗期间也可以配合口服清热利湿、通淋利尿的中成药，比如前列安通片、癃清片、三金片等，也有非常好的辅助治疗效果。除了药物治疗以外，细菌性前列腺炎在治疗的过程中要养成良好生活习惯，不要久坐、憋尿，不要吃辛辣、刺激的东西，不要喝酒，每天应该至少喝水2000mL及以上。