鼠疫的临床分型主要是根据鼠疫杆菌侵犯的部位不同，进行临床分型，具体如下：
第一、腺鼠疫，是临床最多见的一种类型，主要是通过跳蚤叮咬传播，表现为局部淋巴结肿大，可以出现红、肿、热、痛。严重的患者可以出现局部破溃，细菌可以入血，引起继发性败血症和继发性肺鼠疫。
第二、肺鼠疫，分为原发性的肺鼠疫和继发性的肺鼠疫。原发性的肺鼠疫主要是由于肺鼠疫的患者，通过呼吸道飞沫而传播，继发性的肺鼠疫主要是继发于腺鼠疫。
第三、败血症型鼠疫，主要是由于跳蚤叮咬之后，鼠疫杆菌可以直接入血，引起原发性的败血症型鼠疫。继发性的败血症型鼠疫主要是由于腺鼠疫，或者肺鼠疫发展而来。
此外，还有其它的临床类型，比如皮肤鼠疫、肠鼠疫、眼鼠疫，还有脑膜脑炎型鼠疫、扁桃体鼠疫，这些临床类型相对比较少见。