肛周脓肿的脓液流出以后并不是完全痊愈，而是局部脓腔破溃，有可能进一步发展成了肛瘘。肛周脓肿发作以后，患者会出现肛门局部的剧烈疼痛，并且由于局部皮下有脓腔和脓液形成，所以需要尽快对局部脓液进行切开引流，避免脓腔扩散。某些患者由于局部感染程度较大，有可能出现脓腔自行破溃的情况，从而导致脓液流出。肛周脓肿的脓液流出以后，虽然肛门局部的疼痛感会明显减轻，但是由于肛周脓肿的发病原理，和肛管齿线附近的肛窦感染有关，而肛窦局部的内口没有完全处理，说明肛周脓肿并没有完全愈合，有可能后期会发展成为肛瘘，而出现间断性流脓的情况。
所以要想肛周脓肿彻底治愈，在确诊以后需要进行切开引流来减少疼痛，同时还需要进一步进行肛周脓肿一次性根治手术，如果患者发病期间局部脓腔自行破溃而形成肛瘘时，同样需要进行肛瘘切开挂线手术或者肛瘘切除手术。只有手术才能将局部感染灶进行彻底去除，同时将局部的内口进行处理，达到彻底地痊愈。