应用于临床诊断，更针对的检测指标是游离T3、游离T4以及TSH。游离T3、游离T4实际上是T3和T4的生理活性形式，是甲状腺代谢状态的真实反应。二者的测定不会受其结合蛋白质浓度和结合性特性的变化影响，相比较T3、T4更加灵敏，也更有临床意义。而TSH是促甲状腺激素，是测试甲状腺功能非常敏感的特异性参数，FT4浓度的微小变化就会带来TSH浓度向反方向的显著调整。因此在临床上经常会用TSH、FT3和FT4这三项临检来确认甲亢或者是甲低，以及追踪在服药之后的疗效。
针对于影响胎儿智力，主要指的是临床甲状腺功能减退，临床甲状腺功能减退对胎儿的影响比较大，容易增加后代的神经、智力损伤，以及增加早产、流产、低体重儿、死胎和妊娠期高血压疾病的风险。因此，一旦发现是必须要给予治疗的，具体的并不是说T3、T4或者是TSH这三个指标，哪一个指标影响胎儿智力，而是妊娠期的临床甲减对胎儿智商会有较大损害。