目前临床上发现的乙肝小三阳，绝大部分是肝功能持续保持正常、没有任何临床症状的乙肝病毒携带者。但小三阳的病毒携带者，也不是终身不变的。当乙肝小三阳发展为乙型肝炎患者，则会出现肝区不适、食欲不振、恶心、呕吐、厌油腻、腹胀和乏力等症状。
如果合并有黄疸，则尿的颜色会逐渐加深，由啤酒色转为豆油色，同时伴有皮肤、巩膜黄染。如果乙肝小三阳发展为早期肝硬化，症状与乙型肝炎基本相似。
但是也有乙肝小三阳直接发展为晚期肝硬化才被发现，合并腹水，腹胀明显，少尿甚至无尿，才会去就诊，这时食欲不振明显，乏力也会更加明显，但很少发生肝区不适。