男性病人发生泌尿系感染时，如尿道出现尿道刺痒、尿道刺痛或尿道外口分泌物时，可以通过分泌物支原体培养找到支原体。如病人没有尿道口分泌物时，可以通过棉签拭纸、PCR扩增方法来找到支原体感染。
如病人没有分泌物时，还可以选择精液检查，如病人为支原体性前列腺炎时，常常会在精液中出现大量的支原体，通过精液支原体培养常常能找到支原体。
通过选择有效的抗生素如阿奇霉素分散片、盐酸多西环素、左氧氟沙星、红霉素肠溶片等序贯治疗4-6周左右，多数病人支原体感染症状会彻底好转。