脂肪肝患者出现转氨酶升高，药物治疗期间经常会有转氨酶的反复，如果脂肪肝未得到很好地纠正，单靠药物治疗来降低转氨酶，属于治标不治本，停药以后很快会出现转氨酶的反复。所以脂肪肝的治疗，要讲究综合处理，比如经常饮酒的要戒酒。营养过剩、肥胖的患者要控制体重，严格控制饮食，提倡高蛋白、高维生素、低糖、低盐、低脂饮食，尽量不吃或少吃动物性脂肪，如动物的内脏，包括甜食还有碳酸饮料等，都要尽量避免。加强运动，促进体内脂肪的消耗，可以慢跑、快走、骑车、游泳、登山等。
患者若转氨酶明显地升高，可以适当地给予药物治疗。针对脂肪肝，没有特效的治疗药物，常用的有多烯磷脂酰胆碱、护肝片、水飞蓟宾胶囊、还原型谷胱甘肽，这些药物有一定的效果，但是还是要重视调整饮食，加强运动，控制体重。