灰指甲通常指的是指甲的真菌感染，而碘伏的确有抗真菌的作用，但是治疗灰指甲作用不确切。灰指甲的推荐治疗方案是口服药物治疗，只有口服抗真菌药物，通过血液循环到达需要治疗的甲层或甲板下缘，达到杀灭真菌的作用才能彻底根治灰指甲。
碘伏的外用只能暂时性的抑制真菌的生长繁殖。如果遇到比较温暖、潮湿的环境的时候，真菌还是会繁殖，引起灰指甲的复发，所以临床上通常是建议口服抗真菌药。
现在目前临床上最常用的抗真菌药主要有：伊曲康唑、特比萘芬等，口服药的治疗方案通常在说明书上都会有详尽的记载，希望患者到医院就诊，皮肤科大夫会给出确切的治疗方案。
通常口服药的治疗时间，手指的灰指甲通常是3-6个月。而脚趾甲需要6个月到1年的时间才能根治。所以建议广大患者不要购买外用的治疗灰指甲的药物，作用只是管一时，管不了终身，也根治不了灰指甲。