临床上可以根据结膜炎的基本症状、体征，以及病原学检查、细胞学检查进行结膜炎的判断，具体分析如下：
一、临床症状和主要体征：有助于结膜炎的鉴别诊断，结膜炎患者的基本体征为结膜充血、分泌物增多、眼睑肿胀等，其中结膜滤泡、乳头出现的位置和形态，是诊断和鉴别的依据。另外，分泌物多少和性质，也可以帮助判断是何种类型的结膜炎。
二、病原学检查：结膜炎的基本症状有相似之处，但是是何种病因所致的结膜炎，需要进行病原学检查。结膜分泌物涂片有助于判断有无细菌感染，必要时可以做细菌、真菌培养，以及药敏试验等，还可以应用免疫荧光技术的方法检测病原体的抗原。