斑秃从根本的发病机制来讲，是一种自身免疫的机制，在临床上可以看到精神因素，经常是作为诱发自身免疫紊乱最重要的因素。患者在得斑秃之前，往往都会有工作、生活的压力增大，睡眠质量不好，或者是情绪非常糟糕的前提。
除了这个以外，还有自身免疫病会和斑秃是相关的，比如会经常看到斑秃的病人会有甲状腺炎，在斑秃病人的血清里可能会查到自身免疫的抗体。有一些研究认为斑秃和病毒的感染，比如EB病毒的感染，也可能是相关的。