人体感染肺炎支原体后能产生特异性IgM和IgG抗体，IgM抗体出现早，一般在感染后一周出现，3-4周达高峰，以后逐渐降低。由于肺炎支原体感染的潜伏期为2-3周，当患者出现症状而就诊时，IgM抗体已达到相当高的水平，因此，IgM抗体阳性可作为急性感染的诊断标准。
如果IgM抗体阴性，则不能否定肺炎支原体感染，需检测IgG抗体，IgG较IgM出现晚，需动态观察，如显著升高提示近期感染，显著降低说明处于感染后期。IgM与IgG同时测定，可提高诊断率，达到指导用药、提高疗效的目的。肺炎支原体抗体弱阳性不能确定支原体感染，需要重复测定或进行抗体滴度的测定。