患者小拇指第二关节疼痛，常见以下几种原因：
1、外伤：运动的过程中造成小拇指第二关节扭伤，可以引起局部的疼痛、肿胀、活动受限，如果发生骨折或者脱位，疼痛症状会更为明显。拍摄X光片容易发现骨折、脱位，早期复位固定、持续冷敷可以使临床症状得到缓解。
2、退行性骨关节炎：发生于小拇指第二关节时会出现疼痛，常见于老年女性患者，从事家务劳动、接触凉水，使关节退变速度加快，从而诱发疼痛的临床症状，同时会伴有关节畸形，拍摄X光片会发现关节间隙狭窄、关节畸形，早期诊断、早期治疗能够使临床症状得到减轻。