鼻窦囊肿可分为黏液囊肿、黏膜囊肿和发生于上颌窦的牙源性囊肿，具体如下：
1、黏膜囊肿为鼻窦口的长期闭塞，窦内分泌物滞留而形成，黏膜囊肿是窦黏膜的黏液腺、浆液腺管口堵塞，腺体分泌物膨胀而形成，这两类可以通过手术切除，并建立鼻窦和鼻腔的引流来解决。
2、牙源性囊肿分为含牙囊肿和牙根囊肿，前者多发生于青少年，即牙发育异常所致，后者由于牙根尖的肉芽肿退行病变而形成，所以多发生于年龄较大的病人，治疗以摘除囊肿，同时处理病牙为解决方式。