神经功能紊乱的治疗主要是进行对症治疗，首先，因为它的主要表现是失眠、入睡困难、早醒、多梦，还伴焦虑，然后性格的改变、急躁，有些是情绪比较低落伴有抑郁状态。
其次，可以合并躯体化障碍，什么是躯体化障碍？就是病人可以出现头疼、头晕、心慌、心悸、全身无力，有些病人就按照冠心病治疗了，其实是神经功能紊乱伴有一些躯体化障碍。
再次，还容易合并一些消化系统症状，如腹痛、腹胀、腹泻，治疗方面主要是根据患者的情况，建议口服一些调节神经药物，如果患者存在抑郁、焦虑状态明显的情况下，必要时给予抗抑郁、抗焦虑药物治疗。除了药物治疗之外，建议就是保持心情舒畅，避免熬夜劳累，然后适当的运动，分散注意力。
最后，还要积极的控制血压、血糖、血脂，基础病控制理想的同时，植物神经功能紊乱这些症状也会慢慢好起来。