输尿管结石在三处生理狭窄处最为疼痛，这三个部位如下：
第一、肾盂输尿管连接部：即后腰部位，往往结石梗阻在此部位，而产生剧烈的腰痛。
第二、髂血管与输尿管的交叉部：结石也往往停留在这个部位，导致梗阻而引起疼痛，这个位置大约位于平髂骨的位置，也就是中腹部的位置。
第三、输尿管与膀胱的连接部：这个位置位于下腹部，它是输尿管末端比较狭窄的地方，结石停留在此而造成梗阻，除造成腰痛、腹痛之外，还容易造成有尿频、尿急或者里急后重感。
所以，日常生活中需要适当多饮水、多排尿，防止尿液过度浓缩而增加患有结石的概率。