输尿管结石典型的症状为突发肾绞痛，特别为结石突然发作时，出现发作侧腰背部的剧痛，如刀绞一般，疼痛可以沿腰背部向下放射，致腰骶部、小腹、会阴以及外生殖器部位，有时可以达到大腿内侧，发作时可伴有恶心、呕吐、大汗等。
输尿管结石发作期，常会伴有尿潜血或者肉眼血尿，查体时肾区会出现明显的叩痛症状。如果结石合并感染，有可能会出现发热的症状。输尿管结石会引起输尿管梗阻，因而患侧的肾会出现肾积水。如果输尿管结石掉落到输尿管的末端，常会引发下尿路刺激症状，比如出现尿频、尿急、尿痛、尿不尽，以及排尿困难的症状。患了输尿管结石应该积极处理，如果梗阻时间过长，肾积水时间过重，有可能会引发肾功能减退，并且出现不可逆的损害，有部分患者输尿管结石停留时间较长，也可以不出现明显的症状。